El virus del Covid-19 muta constantemente para ser «más exitoso» en su propagación

Este equipo rastreó la tasa de mutación en el proteoma del virus, a través del tiempo, comenzando con el primer genoma del SARS-CoV-2 publicado en enero y terminando con más de 15,300 genomas a finales de mayo.

Así descubrió que algunas regiones todavía están generando nuevas mutaciones, lo que indica una adaptación continua al entorno del anfitrión. Pero la tasa de mutación en otras regiones mostró signos de desaceleración, fusionándose alrededor de versiones únicas de proteínas clave.

«Esas son malas noticias. El virus está cambiando y cambiando, pero está conservando para sí mismo las cosas que son más útiles o interesantes», explica el autor principal del estudio, Gustavo Caetano-Anolles, profesor de bioinformática en el Departamento de Ciencias de los Cultivos de Illinois.

Sin embargo, la estabilización de ciertas proteínas podría ser una buena noticia para el tratamiento. «En el desarrollo de una vacuna, por ejemplo, es necesario saber a qué se están adhiriendo los anticuerpos.

Según el primer autor, Tre Tomaszewski, «para el desarrollo de vacunas, por ejemplo, es necesario saber a qué se adhieren los anticuerpos. Las nuevas mutaciones podrían cambiarlo todo, incluida la forma en que se construyen las proteínas. Saber qué proteínas y estructuras se adhieren proporcionará información importante para las vacunas y otras terapias».

Los investigadores vieron una desaceleración general en la tasa de mutación del virus a partir de abril, después de un período inicial de cambio rápido. Esto incluyó la estabilización dentro de la proteína spike, los apéndices que dan a los coronavirus su apariencia coronada.

« Spike era una proteína completamente diferente al principio de lo que es ahora . Apenas se puede encontrar esa versión inicial ahora», aseguraTomaszewski.

Por alguna razón, «esto debe ayudar al virus a aumentar su propagación y su infectividad al ingresar al huésped. De lo contrario, la mutación no se mantendría», comenta Caetano-Anolles.

Los investigadores también han visto que las regiones del proteoma del virus se vuelven más variables con el tiempo, lo que, según dicen, puede darnos una indicación de qué esperar a continuación con covid-19. Específicamente, encontraron mutaciones crecientes en la proteína de la nucleocápside, que empaqueta el ARN del virus después de ingresar a una célula huésped, y la proteína viroporina 3a, que crea poros en las células huésped para facilitar la liberación, replicación y virulencia viral.

En su opinón, estas son regiones que hay que vigilar, porque el aumento de la variabilidad no aleatoria de estas proteínas sugiere que el virus está buscando activamente formas de mejorar su propagación. Caetano-Anolles explica que estas dos proteínas interfieren en la forma en que nuestros cuerpos combaten el virus. Son los principales bloqueadores de la vía del interferón beta que conforman nuestras defensas antivirales. Su mutación podría explicar las respuestas inmunológicas incontroladas responsables de tantas muertes de covid-19.

«Teniendo en cuenta que este virus estará entre nosotros durante algún tiempo, e speramos que la exploración de las vías mutacionales pueda anticipar objetivos móviles para el rápido desarrollo de terapias y vacunas mientras nos preparamos para la próxima ola », concluyeTomaszewski.